阅读： 2023/9/28 9:40:18
中山大学史俊鹏副教授课题组
GenoShilab
GenoShilab成立于2020年8月，位于深圳市光明区中山大学深圳校区，课题组负责人为史俊鹏副教授（博士生导师，入选中国科协第七届青年托举人才、中山大学“逸仙学者”、深圳市高层次人才）。
课题组主要从事玉米及近缘种的比较基因组学和染色质组学研究。团队现有副教授1人、博士后1人、研究助理1人、研究生5人、本科生4人，已发表研究论文16篇，其中代表性成果以第一和通讯作者（含共同）发表在Nat Genet (2023 & 2018)、Nat Com (2019)、Mol Plant (2023 & 2019)、PNAS (2016)、Plant Com (2023)等杂志。主持国家自然科学基金面上项目（2023 & 2021）、中国科协青年人才托举工程（2021）、国家自然科学基金青年项目（2019）等国家和省部级项目8项。
研究方向
我们立足作物育种前沿——
Q:我们的研究对象？
玉米及其黍亚科近缘作物
Q: 我们的研究手段？
二代和三代测序技术，比较基因组学和染色质组学
Q:我们的研究内容？
作物演化和育种选择过程的基因组结构变异和染色质调控
研究成果
课题组成立以来发表论文：
（*共同第一作者；#共同通讯作者）
1. Zhu Y*, Wang Z*, Zhou Z, Liu Y, Gao X, Guo W, Shi J. HEMU: an integrated Andropogoneae comparative genomics database and analysis platform.bioRxiv, 2023, DOI: https://doi.org/10.1101/2023.05.19.541421
2. Wang Z*, Huang S*, Yang Z, Lai J, Gao X#, Shi J#. A high-quality, phased genome of broomcorn millet reveals the features of its subgenome evolution and 3D chromatin organization.Plant Communications, 2023 May 8;4(3):100557. doi: 10.1016/j.xplc.2023.100557.
3. Shi J#, Tian Z, Lai J & Huang X#. Plant pan-genomics and its applications.Molecular Plant, 2023, 16(1): 168-186.
4. Wang B*, Hou M*, Shi J*, Ku L*, Song W*,..., Chen Y#, Zhao J#, Lai J#, Wang H#. De novo assembly and analysis of twelve founder inbred lines provide genomics insights into heterotic groups and heterosis in maize.Nature Genetics, 55, 312-323 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-022-01283-w.
5. He Q*, Tang S*, Zhi H*, Chen J*,..., Shi J,..., Jia G#, M Purugganan#, Diao X#. A graph-based genome and pan-genome variation of the model plant Setaria. Nature Genetics 55, 1232-1242 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01423-w.
6. Chen J*, Wang Z*, Tan K, Huang W, Shi J,..., Lai J#. A complete telomere-to-telomere assembly of the maize genome.Nature Genetics 55, 1221–1231 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01419-6.
代表性科研项目：
1. 国家自然科学基金面上项目（32372115，玉米及其近缘作物染色质开放性的演化研究，50万元，2024.1-2027.12，负责人，在研）
2. 国家自然科学基金面上项目（32172014，玉米驯化过程中非基因区结构变异的研究，58万元，2022.1-2025.12，负责人，在研）
3. 高校基本业务费中山大学青年拔尖人才培优项目（23lgbj016，玉米及其近缘作物染色质开放性的演化研究，40万，2023.1-2024.12，负责人，在研）
4. 中国科协青年人才托举工程项目（2021QNRC001，45万元，2021.12-2024.12，负责人，在研）
5. 中山大学百人计划人才启动经费（60万元，2020.9-2023.12，负责人，在研）
研究团队
我们团结且充满活力——
课题组负责人
史俊鹏副教授
课题组负责人史俊鹏博士为中山大学“百人计划”引进人才，副教授，博士生导师。长期从事作物基因组学和生物信息学研究，已发表论文16余篇，其中9篇以第一和共同第一作者发表在国际顶尖学术期刊Nat Genet (2023 & 2018)、Nat Com (2019)、Mol Plant (2023 & 2019)、PNAS (2016)、Plant Com (2023)等，总引用超过1000次。主持国家自然科学基金项目3项，入选第七届中国科协青年托举人才。
博士后
高翔博士（2021.11-至今）
主要研究方向：作物基因组学，表观组学以及蛋白质互作组学
简介：有家室，有娃~
研究助理
孔倩倩（2023.7-至今）
主要研究方向：基因组组装及比较基因组学
简介：性格稳重如体重
研究生
刘玉亭（2021.9-至今）
主要研究方向：玉米表观组学
简介：intj天秤座
姜艺（2022.9-至今）
主要研究方向：作物基因组学、玉米表观组学
简介：00年生，我超e的
范晓星（2022.9-至今）
主要研究方向：作物基因组学
简介：理性乐观派！
徐可妍（2023.9-至今）
主要研究方向：玉米表观组学
简介：爱科研爱学习爱生活
李昱辉（浙江农林大学客座，2023.6-至今）
主要研究方向：楠木基因组学和群体遗传学
简介：喜欢科研和篮球
本科生
王梓杰（20级）
主要研究方向：染色质组学、组学数据的整合开发及人工智能挖掘
简介：为天地立心，为生民立命，为往圣继绝学，为万世开太平
朱驭之（20级）
主要研究方向：比较基因组学、染色质组学和组学大数据整合开发
简介：喜欢摄影和打羽毛球，目前尚未找到对象 /doge
刘铸乐（21级）
主要研究方向：比较基因组学、染色质组学
简介：很高兴有机会加入这个大家庭，在这里不仅能学到专业的科研技能，还能认识一群可爱的老师师兄师姐，非常欢迎同学们来我们课题组交流互进。
杨骏宇（20级）
主要研究方向：比较基因组学、染色质组学
简介：爱好音乐＆旅游，想去走遍大江南北
课题组已毕业学生
杨政乐（硕士，中山大学，2021.3-2022.6）
黄诗慧（客座硕士、香港中文大学，2020.8-2022.6）
甘苑娴（硕士，中山大学，2020.9-2023.6）
孔倩倩（硕士，中山大学，2020.9-2023.6）
王志恒（硕士，中山大学，2020.9-2023.6）
张天旭（本科，2020.9-2023.6）
江应平（本科，2020.9-2023.6）
叶笑雨（本科，2020.9-2023.6）
博士后招聘
我们诚挚邀请优秀的你——
岗位职责：
招聘博士后2-3名，独立开展课题，协助课题组组长指导研究生及独立申报科研项目等。
岗位条件：
具有农学、植物学、生物信息学、遗传学等相关专业博士学位，熟悉Linux环境以及Python/R/Perl等编程语言，有一定的统计学基础，或熟悉高通量测序和高通量功能基因组学手段（RNA-seq、ATAC-seq、DAP-seq、Chip-seq等），以第一作者发表过相关高水平论文，年龄不超过35岁，具有良好的英文写作及口头交流能力。
相关待遇：
聘期内提供国内有竞争力的工资、福利待遇（欢迎咨询）。入职中山大学深圳校区的博士后，可以申请居住学校人才房以及深圳市的相关人才待遇和项目。
联系方式：
应聘者请将个人简历、代表性论文的合并版本PDF以附件形式发送至：shijp6@mail.sysu.edu.cn ，邮件标题为“申请人姓名+现单位+博士后申请”，课题组将对应聘者的信息保密。
转自：“iPlants”微信公众号
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