原创 Mark 聊点学术 2019-11-17 18:41

“ 网络药理学是发展创新药物的重要途径。”

网络药理学是基于系统生物学理论而产生的一门新学科。

近年来，特别流行通过网络药理学进行药物的靶点预测，进一步实验验证，一定程度上简化了“盲人摸象式”的前期研究，也增强了最终确定的靶点可信度。即所谓的“干实验+湿实验”。

网络药理学的研究过程需要接触大量的数据库和专业网站，这是保证靶点预测准确度的前提，也是网络药理学的基本功。

因此，如果你想要做网络药理学相关的研究或分析，那么以下网站你必须得熟练查阅。

这里有一个汇总，供参考。

网站名字

网站地址

TTD https://db.idrblab.org/ttd/

Drugbank https://www.drugbank.ca/

DisGeNET http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/menu/home

OMIM http://www.omim.org/

KEGG http://www.kegg.jp/

PharmGkb https://www.pharmgkb.org/

GAD https://geneticassociationdb.nih.gov/

HAGR http://genomics.senescence.info/

T-HOD http://bws.iis.sinica.edu.tw/THOD

CardioGenBase http://www.CardioGenBase.com/

arrhythmia database http://www.fsm.it/cardmoc/

OncoDB.HCC http://oncodb.hcc.ibms.sinica.edu.tw/index.htm

Liverome http://liverome.kobic.re.kr/index.php

Uniprot http://www.uniprot.org/

DAVID https://david.ncifcrf.gov/

STRING https://string-db.org/

BioGRID https://thebiogrid.org/

IntAct https://www.ebi.ac.uk/intact/

HPRD http://www.hprd.org/

GENEMANIA http://genemania.org/

TCMSP http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php

TCMID http://www.megabionet.org/tcmid/

TCM Database@Taiwan http://tcm.cmu.edu.tw/

TCMGeneDIT http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/

BATMAN-TCM http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/

TCM-PTD http://tcm.zju.edu.cn/ptd/

TCM-MESH http://mesh.tcm.microbioinformatics.org/

PubChem https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

HIT http://lifecenter.sgst.cn/hit/

Binding DB http://www.bindingdb.org/bind/index.jsp

ChemBank http://chembank.broadinstitute.org/

ChemMapper http://lilab.ecust.edu.cn/chemmapper/

ALOGPS2.1 http://www.vcclab.org/lab/alogps/

SwissTargetPrediction http://www.swisstargetprediction.ch/

PharmMapper http://lilab.ecust.edu.cn/pharmmapper/index.php

SEA http://sea.bkslab.org/

STITCH http://stitch.embl.de/

PASS http://www.pharmaexpert.ru/PASSOnline/

SuperPred http://prediction.charite.de/

DRAR-CPI http://cpi.bio-x.cn/drar/?page=home

Cytoscape http://www.cytoscape.org/

COXPRESdb http://coxpresdb.jp/

MetaboAnalyst http://www.metaboanalyst.ca/

DAVID https://david.ncifcrf.gov/

Metascape http://metascape.org/

GEO https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

CMAP https://portals.broadinstitute.org/cmap/

affymetrix https://www.affymetrix.com/analysis/netaffx/batch_query.affx?netaffx=netaffx4_annot

Venny2.1 http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

Venn diagram http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

E Chart http://www.ehbio.com/ImageGP/

注：以上网站大多属于国外运营，有时会打不开，并不是网址有误。这种情况也是做网络药理学分析时最不愿意看到的。所以有点子了，就赶紧检索并即时备注检索时间和存储数据，别无他法。

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