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【学术资源】 2022/8/10 8:45:25

空间转录组定量分析及应用—基因调控网络

[摘要]：生物是一个有机整体，我们想要研究组织中的基因表达量多少，除了通过定量分析研究差异表达基因分析，还可以使用基因网络根据表达量变化或者已有的互作关系构建基因调控网络。因为基因网络研究的第一个优势就是系统性，它将个别的基因表达量变化转化为一个整体，能揭示某些微量变化...

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【学术资源】 2022/8/10 8:43:19

这种加了“小竖线”的组合图如何画？

[摘要]：在展示和比较数据（比如基因的表达量、物种的丰度等）分布情况的时候，除了最为常见的箱形图和小提琴图，我们也可以试试其他更为新鲜一点的展示方法。之前在《高分文章中那些“飘逸”的曲线图如何绘制？》一文已为大家介绍过如何使用R语言绘制好看的核密度曲线图，这里再为大家介...

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【学术资源】 2022/8/10 8:41:26

维恩图还能筛选阈值？玩转3种维恩图绘制！！

[摘要]：维恩图（Venn diagram）想必大家都不陌生，可以展示不同集合间的共有、特有信息，除了测序数据分析，其余场景同样适用。OmicShare Tools目前已上线3个维恩图工具，三者在结果及功能上也略有不同，适配多种情况。工具链接：https://www.o...

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【学术资源】 2022/8/10 8:39:31

如何将通路图导入到Cytoscape中？

[摘要]：安装插件首先，通过App菜单下的“App Manager” 进入Cytoscape的插件管理器。App菜单下的其他选项为之前已经安装好的一些插件。在插件管理器中的Search栏中，只需输入插件的名称（如这里只需前几个字母wiki）可快速找到相应的插件，用鼠标选...

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【学术资源】 2022/8/10 8:36:19

如何绘制高分必备的各类常见图表？要学就 all in！

[摘要]：在探索数据时，如何做到快速又轻松获得漂亮的发表级图表呢？今天给大家推荐一款基于ggplot2的可视化R包grafify，包中内置多类科研人所需的常见图表和配色方案，代码简单，并且不同图表函数的参数逻辑一致，学会一个基本就能all in 全部图表的绘制方法！发表...

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【学术资源】 2022/8/8 14:04:44

新时代的标志：新传播技术的爆炸、信息生产的巨大增加和劳动力分配的重大变化

[摘要]：新传播技术的爆炸我们生活在四十年代的三个值得注意的年头的预兆的影响之下。一九四五年，我们看到克拉克的刊登在英国广播杂志《无线电世界》的题为《太空中继站》这篇只有四页的文章。它以惊人的预见，提出了通讯卫星的想法和它的潜力。一九四六年，看到封 ?纽曼的关于现代计算...

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【学术资源】 2022/8/8 11:49:00

媒介议程安排：媒介对舆论的效果有多大？

[摘要]：媒介对舆论的效果我们已经指出，要举出大众媒介对舆论的特定效果的困难。这一点使那些试图找出电视对政治态度和投票有何具体影响的研究者的大多数感到泄气。一方面，电视使政治产生了很大的变化是清楚的。另一方面，哥伦比亚大学应用社会学研究部的研究人员对两次总统选举所作研究...

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【学术资源】 2022/8/8 11:45:15

媒介事件：有意制造来供媒介作报道的事件

[摘要]：有意安排的事件丹尼尔·波尔斯丁用历史学家的眼光来观察当代的生活，在一些年以前就察觉到，当前的历史开为“有意安排的事件”——主要是制造来供媒介作报道的事件。换句话说，不是随着新闻的潮流行动，灵巧的人学会了怎样去推动新闻本身。当然。这种作法要比电视早得多。当报纸还...

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【学术资源】 2022/8/5 9:26:31

接力AlphaFold，星药科技发布TBind，开启分子蛋白复合物结构预测新纪元

[摘要]：继2018年、2020年的两代 AlphaFold 的横空出世后，蛋白质结构预测已经接近实验精度，为计算赋能药物研发领域打下了坚实基础。在药物研发漫长的研发环节中，分子与蛋白质的相互作用预测是下一个计算赋能药物研发领域的“圣杯”。近日，星药科技在预印本平台 b...

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【学术资源】 2022/8/4 11:00:05

肿瘤微环境的三大类别

[摘要]：本期继续分享肿瘤微环境的分类：在过去的十年里，癌症治疗发生了一场革命，从广泛靶向肿瘤的药物（如化疗和放疗）转向使用基于抗体的免疫疗法，以调节针对肿瘤的免疫反应。第一代基于抗体的免疫疗法，即所谓的免疫检查点阻断(immune-checkpoint blockad...

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