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  • 细胞裂解液配方和选择

    阅读: 2024/1/27 9:04:58

    细胞裂解液的目的:

    (1)利用去垢剂破坏脂质双分子层,破裂细胞;

    (2)溶解蛋白;

    (3)蛋白变性使其稳定;

    (4)抑制蛋白酶活性。

    常见的细胞裂解液成分:

    50mM Tris-HCl pH7.4 (缓冲体系)

    150mM NaCl (等渗体系)

    1mM PMSF (蛋白酶抑制剂)

    1mM EDTA (变性剂和稳定剂)

    5μg/ml Aprotinin (蛋白酶抑制剂)

    5μg/ml Leupeptin (蛋白酶抑制剂)

    1% Triton X-100 (弱变性剂)

    1% Sodium deoxycholate (中度变性剂和溶解剂)

    0.1% SDS (强变性剂和溶解剂)

    细胞裂解液的一般成分:

    1. 裂解成分:破坏细胞膜裂解组织或细胞。

    裂解强度:SDS(基本会使蛋白变性失活) > Triton X-100 > NP-40

    英文名

    中文名

    裂解强度和去垢剂类型

    作用

    Sodium
    Deoxycholate

    脱氧胆酸钠

    中度;阴离子型

    能够有效破坏多种蛋白间的相互作用

    1%
    Triton X-100

    曲拉通X-100

    温和;非离子型

    溶解脂质,增加细胞膜的通透性

    0.1%
    SDS

    十二烷基硫酸钠

    强;阴离子型

    强变性,极易促溶,能够有效破坏多种蛋白间的相互作用

    1%
    NP-40

    乙基苯基聚乙二醇

    温和;非离子型

    可破坏掉细胞膜,获得胞浆蛋白,对核膜的破坏作用较弱

    2. 蛋白酶抑制剂:抑制蛋白酶的活性,避免蛋白过度降解。

    英文名

    中文名

    作用

    PMSF

    苯甲基磺酰氟

    抑制丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶

    Leupeptin

    亮肽素

    抑制丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶

    Aprotinin

    抑肽酶

    抑制丝氨酸蛋白酶

    Pepstatin

    胃酶抑制剂

    抑制天冬氨酸蛋白酶、多种微生物酸性蛋白酶

    EDTA-Na2

    乙二胺四乙酸

    多数核酸酶和有些蛋白酶需要金属离子激活酶的活性,EDTA可螯合金属离子,抑制酶活

    3. 磷酸酶抑制剂:抑制去磷酸化作用。

    英文名

    中文名

    作用

    NaF

    氟化钠

    抑制去磷酸化作用

    Na2VO4

    钒酸钠

    抑制去磷酸化作用

    Beta-glycerophosphate

    β-甘油磷酸酯

    抑制去磷酸化作用

    Na2PO4

    磷酸钠

    抑制去磷酸化作用

    * 可根据目的蛋白的特性对裂解液配方做出调整,例如:非磷酸化蛋白可不添加磷酸酶抑制剂;IP背景高,选用裂解度高的裂解液;目的蛋白IP 不下来,选用裂解度低的裂解液等等。

    细胞裂解液影响细胞膜和核膜的破坏效率, 所以应根据目标分子在细胞内的定位选择裂解液。此外,不同的细胞和组织具有不同的膜组成和结构,需要针对其特性选择特定裂解液。使用错误的细胞裂解液可能导致细胞裂解不完全,进而影响数据的准确性。

    适当的裂解液对于维持细胞内目标分子的稳定性和完整性至关重要。例如,在核酸研究中,裂解液会影响RNA、DNA及其修饰的完整性。在蛋白质组学中,它影响蛋白质和翻译后修饰的稳定性。使用错误的缓冲液可能导致这些分子的降解或变性,从而损害下游分析的准确性。

    细胞裂解液对试验结果的一致性有重要的影响。不同的缓冲液pH值、离子强度和去垢剂不同,这些因素可能影响酶、蛋白质和其他细胞组分的结构和活性。保持缓冲液一致性对于确保实验的可重复性至关重要。

    转自:“医学科研小坑”微信公众号

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