论文查重系统的运算规则通常包括以下几点：

1.文章分割：系统将输入的文章分割成适当的段落或句子，并为每个段落或句子生成唯一的标识符。

2.特征提取：系统从每个段落或句子中提取特征，例如词频、词性、命名实体等。这些特征可以用来比较和计算相似度。

3.相似度计算：系统使用相似度算法（例如余弦相似度、Jaccard相似度等）计算输入文章之间的相似度。

4.参考文献匹配：系统将输入文章中的参考文献与已知的引用文献进行匹配，检查其是否存在相似或重复的部分。

5.抄袭检测：系统将输入文章与已知的文献数据库进行比较，查找其中是否存在相似或重复的部分，并给出相似度报告或抄袭警告。

6.结果显示：系统将检测结果展示给用户，包括相似度报告、重复文本的位置等信息。

需要注意的是，每个论文查重系统可能使用不同的运算规则和算法，具体规则和算法的选择会影响系统的性能和准确性。

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