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  • 选择抗体时的“九个大坑”,你中招了吗?

    阅读: 2023/9/11 10:29:17

    如何选择正确的抗体

    1、蛋白的名称和亚型

    经常拿到一些“似是而非”的英文名称或简称,查的时候不确定推荐的是否就是要检测的靶标。针对这个问题,建议大家参考uniprot蛋白数据库,大部分抗体说明书的 “数据库链接”部分,有针对不同种属的基因和蛋白数据库链接, 其中显示SwissProt的就是该蛋白的数据库链接,点击进去后,页面的左边有筛选框,可以点击感兴趣的部分查看。

    点击Names&Taxonomy部分,可以看到该靶标的基因名称和蛋白名称,以及替代名称,也就是所谓的别名,可以核对名称是否可以对应上,如此判断该抗体是否适合。

    另外,关于蛋白亚型问题,在这里也可以找到答案,点击Sequences部分,可以看到该蛋白有几个亚型,每个亚型的具体氨基酸序列和分子量大小,如果做WB实验,就可以预估条带位置。

    不能不说,SwissProt数据库实在太强大了,常问到的亚细胞定位-Subcellular location,翻译后修饰-PTM/Processing部分,具体的修饰位点和修饰基团等,都可以一一查看到。

    5、制备抗体的免疫原

    在说明书中的免疫原,即Immunogen 部分,经常如下描述,Synthetic peptide within Human X aa 200-250. The exact sequence is proprietary.或者Recombinant full length protein corresponding to X(这里的X指的是蛋白的名称).建议您根据您的实验目的,去选择合适的抗体,如果您没有特殊实验要求,那么全长的免疫原序列是不错的选择。

    5、单克隆抗体和多克隆抗体

    经常有用户问到,单克隆还是多克隆抗体好?其实在回答这个问题前,我们要先解释下这两者的含义,简单来讲,单克隆抗体只能识别抗原的特定抗原表位,而多克隆抗体可以识别抗原的多个抗原表位,所以,单克隆抗体特异性高而灵敏度相对低一些,多克隆灵敏度高而特异性低一些,在不同实验操作时,可以根据如下表格有侧重选择。


    单克隆抗体

    多克隆抗体

    特异性

     ++

     +

    批间差

     ++

     +

    灵敏度

     +

     ++

    WB

     +

     ++

    IHC

     +

     ++

    ICC

     ++

     +

    FlowCyt

     ++

     +

    7、抗体的克隆号

    克隆号是给单克隆杂交瘤细胞产生的抗体的编号。每个杂交瘤细胞克隆产生单个纯同质型抗体。克隆号相同的抗体代表制备抗体时的免疫原序列是相同的。

    8、抗体的偶联物

    常见的偶联物有酶、荧光素、生物素等,常见的酶有辣根过氧化物酶-HRP、碱性磷酸酶-AP等,常见的荧光素有传统荧光素FITC、APC、Pe、Pe-cy3、Pe-cy5等,新型荧光素包括Alexa Fluor? 系列和DyLight? 系列各波长的荧光素,一般做多重免疫染色时,会考虑选择直接标记荧光素的一抗,建议您先核实实验室仪器的荧光显微镜或流式细胞仪的配置,选择匹配仪器的激发波长或通道的荧光抗体,尽量避免光谱重叠。

    如果您需要寻找双标记和三标记免疫荧光染色实验中的常见组合,我们推荐如下:

    免疫染色

    抗体组合

    双色

    Alexa Fluor? 488和Alexa Fluor? 647

    三色

    Alexa Fluor? 405、Alexa Fluor? 555和Alexa Fluor? 647

    9、抗体验证

    这里我们重点说下目前有说服力的基因敲除验证,即KO验证,该方法使用单倍体细胞模型的 CRISPR/Cas9 KO 人类细胞系。敲除模型是真正意义上的阴性对照,是抗体验证的标准品。

    转自:“医学科研小坑”微信公众号

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